Quando os itens não são puxados para dentro do contrato voce deve verificar o seguinte:

Os contratos vencidos foram baixados?

A forma de apuração da licitação é por item ou por lote? Se for por lote, então o sistema não poderá puxar nenhum item. Veja no tópico anterior como fazer para cadastrar contratos em licitações cuja apuração foi por lote.